Pedagogická činnost členů centra GEEN je poměrně bohatá. Podílejí se na přípravě budoucích učitelů zeměpisu (viz bakalářské a navazující magisterské studium) i na přípravě odborníků zabývajících se problematikou geografického vzdělávání (viz doktorské studium). Organizují a lektorují také kurzy adresované učitelům z praxe. V současnosti jsou MŠMT akreditované tři kurzy pro učitele. Kurzy jsou realizovány, v případě přihlášení minimálně 5 zájemců.
Mezi pedagogickou činnost centra patří:
výuka v bakalářském, navazujícím magisterském a doktorském studiu
výuka v kurzech celoživotního vzdělávání
výuka v kurzech dalšího vzdělávání pedagogických pracovníků
výuka v přípravném kurzu pro uchazeče ke studiu geografie
